검역세균 Xanthomonas spp. 동정시스템

Xanthomonas spp.
동정시스템

MLSA

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Sequence Information

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3

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4

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Project Info.

Project Name Project Memo

Input File List

Input File Name 1	Input File Name 2	Sample Name	Gene Name	Merge Seq (bp)	GetGene Seq (bp)	Date
Xanthomonas_arboricola_Test		Xanthomonas_arboricola_Test	16sRNA	1547	1547	23-10-22
Xanthomonas_arboricola_pv._juglandis_str._NCPPB_1447__cpn60.fasta		Xanthomonas_arboricola_Test	cpn60	1641	1641	23-10-22
Xanthomonas_arboricola_pv._juglandis_str._NCPPB_1447__gyrB.fasta		Xanthomonas_arboricola_Test	gyrB	2445	2445	23-10-22
Xanthomonas_arboricola_pv._juglandis_str._NCPPB_1447__FyuA.fasta		Xanthomonas_arboricola_Test	FyuA	2457	2457	23-10-22
Xanthomonas_arboricola_pv._juglandis_str._NCPPB_1447__dnaK.fasta		Xanthomonas_arboricola_Test	dnaK	1926	1926	23-10-22
Xanthomonas_arboricola_pv._juglandis_str._NCPPB_1447__rpoD.fasta		Xanthomonas_arboricola_Test	rpoD	1875	1875	23-10-22
Xanthomonas_campestris_pv._armoraciae_NCPPB_347__16sRNA.fasta		Xanthomonas_campestris_pv_armoraciae_Test	16sRNA	1547	1547	23-10-22
Xanthomonas_campestris_pv._armoraciae_NCPPB_347__cpn60.fasta		Xanthomonas_campestris_pv_armoraciae_Test	cpn60	1641	1641	23-10-22
Xanthomonas_campestris_pv._armoraciae_NCPPB_347__FyuA.fasta		Xanthomonas_campestris_pv_armoraciae_Test	FyuA	2457	2457	23-10-22
Xanthomonas_campestris_pv._armoraciae_NCPPB_347__gyrB.fasta		Xanthomonas_campestris_pv_armoraciae_Test	gyrB	2445	2445	23-10-22
Xanthomonas_campestris_pv._armoraciae_NCPPB_347__dnaK.fasta		Xanthomonas_campestris_pv_armoraciae_Test	dnaK	1923	1923	23-10-22
Xanthomonas_campestris_pv._armoraciae_NCPPB_347__rpoD.fasta		Xanthomonas_campestris_pv_armoraciae_Test	rpoD	1875	1875	23-10-22
Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913__16sRNA.fasta		Xanthomonas_campestris_pv_campestris_Test	16sRNA	1547	1547	23-10-22
Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913__cpn60.fasta		Xanthomonas_campestris_pv_campestris_Test	cpn60	1641	1641	23-10-22
Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913__gyrB.fasta		Xanthomonas_campestris_pv_campestris_Test	gyrB	2445	2445	23-10-22
Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913__FyuA.fasta		Xanthomonas_campestris_pv_campestris_Test	FyuA	2457	2457	23-10-22
Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913__dnaK.fasta		Xanthomonas_campestris_pv_campestris_Test	dnaK	1923	1923	23-10-22
Xanthomonas_campestris_pv._campestris_str._ATCC_33913__rpoD.fasta		Xanthomonas_campestris_pv_campestris_Test	rpoD	1875	1875	23-10-22

User Sample Select

All	Species Name	16sRNA	cpn60	gyrB	Co1	avrBs2	FyuA	dnaK	rpoD	Write Date
17	Xanthomonas_arboricola_Test									23-10-22
18	Xanthomonas_campestris_pv_armoraciae_Test									23-10-22
19	Xanthomonas_campestris_pv_campestris_Test									23-10-22

Align List

Align Name	Gene List	#User List	#Compare List	State	Reg. Date	Result	Tree
Xanthomonas_arboricola_All	16sRNA,cpn60,gyrB,avrBs2,FyuA,dnaK,rpoD	1	9	Success	23-10-22
Xanthomonas_campestris_pv_armoraciae_All	16sRNA,cpn60,gyrB,dnaK,rpoD	1	20	Success	23-10-22
Xanthomonas_campestris_pv_campestris_All	cpn60,gyrB,avrBs2,FyuA,dnaK,rpoD	1	10	Success	23-10-22
multi_species_Test	cpn60,gyrB,dnaK,rpoD	3	22	Success	23-10-23